俄勒冈大学研究人员发现的一种新的基因编辑技术显着减少了研究时间,使得探索以前无法探索的几个领域成为可能。借助这种方法,生物学家现在可以比较基因的多个版本,以找到产生特定性状的突变,同时还可以跟踪它们随时间的演变。
通过进行此类研究,科学家们在识别与人类健康相关的突变或了解人类疾病的机制方面迈出了重要的一步。尽管之前已经针对细菌和酵母等单细胞生物开发了大规模基因编辑技术,但这是第一次在动物身上实现如此规模的基因编辑技术。
基因编辑向前迈进
“在生物学中,我们花了很多时间研究基因突变体。但在动物身上,我们受到一次可以产生多少基因突变体的限制,”研究人员说 扎克史蒂文森,谁帮助设计了这项技术。 “这是绕过这一瓶颈的新方法。”
史蒂文森和他的同事在 bioRxiv 上发表的预印本中描述了他们的新技术。 我把它链接到你这里。
该系统是用小虫子开发的 秀丽隐杆线虫,史蒂文森说,它也可以在其他实验动物身上起作用,比如苍蝇或老鼠。
因为很重要
科学家可能希望能够同时产生许多基因突变的原因有很多。 例如,他们可能正在编辑一种突变,使动物对特定药物产生抗药性,或者能够在某些条件下生存,或者不太容易感染疾病。
他们可能需要查看一个基因的数十种甚至数百种可能的变异,才能找到最有效的变异。
此类编辑的工程 实验遗传 动物的速度极其缓慢。每一种突变菌株都是经过预先确定的基因修饰的蠕虫的集合,必须逐一创建。史蒂文森说:“通常,需要七到十个小时的练习”才能创造出一个突变体。这个新发现的系统允许您“创建数万个”,而现在只需要创建三个或四个。
新方法的工作原理
为了加快速度,史蒂文森和他的同事设计了一种方法,将数百甚至数千个可能的突变压缩到一个“库”中。图书馆里的每一本书都是遗传密码的一小部分,其本身微不足道且无功能。每个片段都适合目标基因中的一个工程“利基”。
这种设计实现了真正的范式转变:研究人员可以将整个突变库注入一只蠕虫体内,而不是单独注射具有不同版本基因的许多个体蠕虫。
然后,当蠕虫繁殖时,图书馆就会扩大。 在每个后代中,从突变库中随机选择一本书来补充目标基因。 结果:一系列蠕虫都具有不同的随机选择的基因突变。
研究人员将他们的技术称为 TARDIS,这是对 Dr. Who 的时空旅行警舱的一种俏皮点头。 这里它代表导致集成序列多样性的转基因阵列。
编辑 2.0 的可能应用
研究人员用一种使蠕虫对抗生素产生抗药性的基因对 TARDIS 进行了测试。 但他们看到了生物学的广泛应用,包括对其他模式生物的研究。
俄勒冈大学研究教授表示,它对于研究蛋白质之间的相互作用或细胞之间的信号传导特别有用 斯蒂芬·班斯,这有助于开发 TARDIS。 Banse说,这种相互作用通常与理解疾病有关,但科学家们通过在酵母或细菌中研究它们而失去了重要的背景。
“现在我们可以在动物模型中做这些事情。”然后是在人身上。